Le référentiel BD LISA (Base de Données des Limites des Systèmes Aquifères) actuellement en diffusion est la version 2.

Ce référentiel comporte les jeux de données géographiques suivants :
- Entités hydrogéologiques de niveau 3 (local) ;
- Polygones élémentaires délimitant chaque pile unique d'entités hydrogéologiques ;
- Zones karstiques, zones caractérisées comme étant de milieu karstique ou alimentant des sources karstiques;
- Zones altérites meubles, polygones d’extension des zones au sein desquelles la présence de formations géologiques altérées meubles (saprolite) a été mise en évidence ou est supposée.

Ainsi que des tables d'informations complémentaires :
- Le tableau multi-échelle comportant l'ensemble des entités hydrogéologiques cartographiées (niveaux 1, 2 et 3)
- La table de généalogie récapitulant les modifications réalisées entre la version 1 et la version 2 de la BDLISA.
- La table des piles d'entités hydrogéologiques qui associe chaque polygone élémentaire aux entités hydrogéologiques de niveau 3 présentes sous ce polygone, en les ordonnant verticalement.